Mänsklig användning av djur, inklusive reptiler och amfibier, är en integrerad del av många kulturer. Skörden måste dock vara biologiskt hållbar om populationer och arter ska kvarstå (Pough et al. 1998). Overcollection för mat, handel med sällskapsdjur och biologiska leverans hus har föreslagits ha haft en inverkan på vissa amfibie populationer (Wahlström 1997). I USA, anmärkningsvärda exempel för amfibier inträffade i slutet av 1800-talet till början av 1900-talet, när kommersiella samlare skördas för grodan ben marknaden. Hundratusentals red-legged grodor (Rana aurora draytonii) samlades in från våtmarker i Kalifornien (Jennings och Hayes 1985), och över 20 miljoner leopard grodor (Rana pipiens) togs årligen i nordvästra Iowa (Lannoo et al. 1994). Midwestern våtmarker idag har färre grodor, även om det är svårt att fördela de relativa förlusterna bland orsakerna till våtmark livsmiljö förstörelse och nedbrytning, införande av rovdjur, och tidigare kommersiella effekter (Lannoo et al. 1994). I Indien har grodlårshandeln resulterat i allvarliga befolkningsminskningar av den indiska tjurfäktningen (Rana tigrina) och den gröna dammbrodan (Rana hexadactyla). uppskattningsvis 70 miljoner grodor exporteras olagligt varje år (Oza 1990).
Mänsklig användning av en art är hållbar om den kan fortsätta på obestämd tid utan negativa effekter på befolkningens överlevnad (Ross 1998). Mycket av användningen av reptiler är tydligt ohållbar. Kommersiella effekter på reptil har varit mer genomgripande och allvarliga än på amfibier (t.ex. se Williams 1999). Svårighetsgraden av sköldpaddkrisen i global skala betonades av Rhodin (1999), som rapporterade att av de cirka 293 taxa (främst arter, men inklusive vissa underarter) av sötvattensköldpaddor, sköldpaddor och havssköldpaddor som är kända för att vara bevarade under de senaste århundradena, är 3% (9 taxa) redan utrotade i naturen. Ytterligare 4% (12 taxa) är allvarligt hotade, 11% (32 taxa) är hotade och 21% (61 taxa) är sårbara.
Krisen är särskilt akut för asiatiska sötvattensköldpaddor och sköldpaddor, som skördas som en lokal livsmedelskälla. Dessutom är den internationella handeln med sköldpaddor-som äts, säljs som husdjur eller används i traditionella kinesiska medicinska läkemedel—både omfattande och oreglerade (Sharma 1999). En färsk rapport visade att de flesta sköldpaddsarter i Vietnam och södra Kina är hotade och att sköldpaddor inte längre kan hittas i naturen i Vietnam (Kiester och Juvik 1997). Kina är den största konsumenten av sköldpaddor i livsmedelshandeln. Eftersom handeln med sköldpaddor inte är reglerad har få poster hållits, men befintliga register tyder på att handeln med levande sköldpaddor till Kina är tusentals ton per år (Mockenhaupt 1999). Den kommersiella handeln med sötvattenssköldpaddor överstiger alla möjliga hållbara nivåer, och utrotning av vissa arter i naturen kan förväntas inom det närmaste decenniet.
De flesta arter av havssköldpaddor fortsätter att minska i alla varma oceaner i världen. Leatherback sea turtle (Dermochelys coriacea) rapporterades nyligen vara “på väg till utrotning och ytterligare befolkningsminskningar kan förväntas” om inte lämpliga åtgärder vidtas för att minska dödligheten hos vuxna, hatchlings och ägg (Spotila et al. 1996). Den uppskattade världsomspännande befolkningen av läderbackar som häckar på stränder 1980 var 115 000, jämfört med bara 34 500 år 1995. Exploatering av läderbackar i Atlanten, genom olaglig skörd av både vuxna och ägg, anses vara en viktig bidragande orsak till arternas nedgång (Spotila et al. 1996). För Kemps Ridley sea turtle (Lepidochelys kempii) bidrog skördar av häckande honor och deras ägg på den största kända häckningsplatsen till nedgångar från 42 000 häckande Honor 1947 till endast några hundra år 1975 (Hildebrand 1982).
Bland nordamerikanska sköldpaddor minskade diamondback terrapin (Malaclemys terrapin), en liten, flodmynning sköldpadda arter med ett geografiskt område från Cape torsk till Texas, kraftigt efter kraftig exploatering som en gourmet mat objekt från slutet av 1800-talet till början av 1900-talet (Carr 1952). Med tvångsminskningar i skörden kunde många populationer återhämta sig, men terrapin står nu inför betydande nya hot, inklusive motorvägsdödlighet (trä och Herlands 1997) och drunkning i kommersiella och rekreationskrabbfällor (biskop 1983, Roosenburg 1991). Förnyad kommersiell skörd av diamondback terrapin har också dokumenterats (Garber 1988).
Kommersiella sköldpadda trappers för restauranghandeln intensifierade skördar av en av de största sötvatten sköldpaddor i världen, alligator snapper (Macroclemys temminckii), från 1960-talet till 1980-talet (Roman et al. 1999). Följaktligen, som bevis från undersökningar tyder på, har arten drastiskt minskat i antal i några av de sydöstra amerikanska floderna som den en gång bebodde (Moler 1992, Jensen 1998).
Den enorma och när gemensamma populationer av arrau (Podocnemis expansa), en viskande häckande turtle av Orinoco och Amazonas Floder i Sydamerika, är nu kraftigt reducerad i storlek på grund av konsumtion av ägg och häckande honor (Pritchard och Trebbau 1984), ett överutnyttjande problem som identifierats nästan två århundraden sedan (Humboldt 1814, från Pritchard och Trebbau 1984). Avstår från liknande orsaker har drabbat terecay (Podocnemis unifilis) i tropiska låglandet i Sydamerika (Thorbjarnarson et al. 1993) och river terrapin (Batagur baska) i Indien (Bhupathy 1997).
Overharvesting för mat är ett problem inte bara för sköldpaddor utan även för ödlor, har bidragit till nedgångar i gröna leguaner (Iguana iguana) och taggiga tailed leguaner (Ctenosaura similis) i tropiska Amerika (Fitch et al. 1982).
Pet-handeln verkar särskilt farlig för vissa sköldpaddsarter. År 1994 rapporterades befolkningsminskningar i box turtles (Terrapene carolina) i 16 stater, allt från Massachusetts till Florida och Oklahoma till Wisconsin (Lieberman 1994). Dokumentation av box turtle minskar—inklusive uppgifter som visar att, sedan 1995, 29,896 box sköldpaddor hade samlats för handeln med sällskapsdjur och levereras från Louisiana—resulterade i en enhällig passage av Lagen 81 av Louisiana Senaten och representanthuset i 1999; lagen förbjuder kommersiella skörd av statens native box turtle populationer. Översamling för export är en allvarlig faktor i en stor del av box turtle nedgång och kan förvärra effekterna av livsmiljö förlust (Lieberman 1994). Förstörelse av livsmiljöer och olaglig insamling för handeln med sällskapsdjur är de främsta hoten mot mossen sköldpaddor (Clemmys muhlenbergii); Copeyon 1997). Antalet nordliga populationer har minskat med 50%, med större delen av nedgången under de senaste 20 åren. Av de 191 återstående Bog sköldpadda livsmiljöer kända 1996, 33 klassificerades som i gott skick, 67 som rättvis, och 76 som fattiga; status 15 var okänd.
Overcollecting är också ett problem för vissa ormarter. Den ocellaterade berget viper (Vipera wagneri) i östra Turkiet har sökts av pet-handeln och avlägsnats från naturen i stort antal, vilket utgör “ett allvarligt hot mot artens överlevnad” (Nilson et al. 1990). Populationer av flera boa och python arter har minskat på grund av insamling av vilda ormar för deras skinn (Pough et al. 1998). Snabba nedgångar av stora ormar, som tenderar att ha en svit av livshistoriska egenskaper som gör dem mer mottagliga för befolkningsminskningar än mindre arter (t.ex. Dodd 1993), har dokumenterats över hela världen under de senaste åren (t. ex. Shine och Fitzgerald 1996). Till exempel, kvinnor i allt sällsynta virke skallerorm (Crotalus horridus), som kan överstiga en meter i längd och normalt tar 9 år för att nå mognad, producerar färre än ett dussin unga var 3 år (brun 1993). Stora arter som skallerormar (Crotalus) har långa generationstider, ett livshistoria drag som, i kombination med förlust av livsmiljöer, mänsklig förföljelse, och intensiv översamling (t.ex. “skallerormar roundups”; Brown 1993), har lett till dramatiska nedgångar av vissa arter och gjort ungefär en tredjedel av skallerormarter sårbara för utrotning (Greene 1997). Hög skörd priser för ormar med låg reproduktion frekvenser, såsom filesnake (Acrochordus arafurae) i Australien, skulle nästan säkert vara ohållbar (Shine m.fl. 1995).
Dessa exempel visar att hållbar användning av vissa långlivade reptilarter är problematisk. Eftersom livslängd i reptiler är förknippad med fördröjd sexuell mognad, hög vuxenöverlevnad och låg fecundity (Pough et al. 1998), populationer av långlivade arter kan inte förbli stabila (eller växa) när vuxna och äldre ungdomar skördas i höga hastigheter (Congdon et al. 1993, 1994). Detta betyder dock inte att alla sådana långlivade arter bör vara kommersiellt gränslösa. Nyckeln till hållbarhet är att ha Arts-och befolkningsspecifika förvaltningsplaner och tätt kontrollerad användning (Ross 1998).